陈茂盛 曹睿殊
提及生物分类，人们自然会想到林耐。其实，人类从认识物种起，就已经开始试图根据生物的特征为其取名，以示区分。
西方早期的分类思想
远在柏拉图时代，人们就按照对分原则将动物划分为互成对比的两类，如陆上动物和水居动物，有翅动物和无翅动物等，这种方法虽然原始，却为分类方法提供了有效的出发点。此后，出生于医生世家的亚里士多德以有没有红色的血液为标准，把动物分成了有血液动物和无血液动物两大类。这种分法基本相当于我们今天分的脊椎动物和无脊椎动物两大类。根据生殖方式的不同，亚里士多德还把动物分布在由低等到高等动物组成的“生物阶梯”上，哺乳类处于阶梯顶端，往下是鸟类、爬行动物，再低等是青蛙、鱼，最低等的是虱子、跳蚤等。亚里士多德最早注意到要按生物的亲缘关系来建立分类系统，而且他的生物阶梯观点体现了生物进化论的萌芽，因此，亚里士多德常被人们称为系统分类学的先驱。
亚里士多德一共对近500种动物进行了描述和分类，他的弟子德奥弗拉斯特则在植物学方面作出了巨大贡献。德奥弗拉斯特还在亚里士多德同柏拉图相互合作的时候，就开始在柏拉图的学园里教哲学课程。柏拉图死后，德奥弗拉斯特就跟随着亚里士多德，并成了他的忠实学生、朋友和主要助手。德奥弗拉斯特最基本的贡献是他明确地区分了植物与动物，最早创立了双名法，对许多植物进行了命名，并建立了初步的分类系统。
人为和自然分类之争
近代生物分类学从16世纪中期兴起，在此后持续一个半世纪的发展之中，不但积累了丰富的物种资料，而且还由于不同的宗教背景的影响，初步形成了两种截然不同的分类法：人为分类法与自然分类法。
人为分类法的基本方法是，根据生物体的简单特征，将生物物种人为地划分为不连续的、有等级序列的若干级类别。这种分类法形成和发展于天主教流行的国家。近代生物分类学的先驱、意大利生物学家契沙尔比诺和另一个生物学家马尔比基则是人为分类法的代表人物。
契沙尔比诺深受亚里士多德的生殖灵魂论及其最初的人为分类法的影响，认为生物的生殖器官是机体的灵魂，而这种生殖灵魂，对植物来说，则表现为果和根：靠果繁殖，靠根生长。因此，在植物分类中，他以果和根的形态特征作为分类的主要标准，初步建立起了近代的第一个生物分类的人为系统。
此后过了70余年，意大利的另外一些生物学家试图把契沙尔比诺的人为分类法广泛地运用到包括动物在内的所有生物物种的分类上，从而建立起完整的生物分类系统。最先把人为分类法引入动物分类学的生物学家，是显微解剖学奠基人之一的马尔比基。他认为，对动物来说，呼吸器官的完善程度是生物呈等级序列的主要标准。于是，他以生物呼吸器官的形态特征为主要依据，将所有生物按植物、昆虫、鱼类、高等动物、人这种等级序列进行了统一的分类。
自然分类法的基本方法是，选取植物和动物的多种器官乃至全部器官的形态特征作为分类标准，然后把生物物种自然地划分为连续的、彼此有亲缘关系的若干类别。这种分类法形成和发展于新教比较流行的国家，荷兰生物学家洛比留斯、瑞士生物学家鲍兴、英国地质和生物学家约翰·雷伊则是这种分类法的代表人物。
自然分类法强调分类中的多标准以及物种之间的亲缘关系。瑞士生物学家鲍兴曾在1623年完成了对他当时所知的近6 000种植物的分类。鲍兴在建立他的植物自然分类体系时，还广泛地采用了德奥弗拉斯特的双名法为6 000余种植物命名。由于生物种类繁多，而命名又极不统一，就给生物进行统一分类带来了极大的困难，一直到17世纪初期，双名法也未能成为统一的命名法。
继鲍兴之后，约翰·雷伊进一步推动了自然分类法的发展，他认为，在选用分类标准时，不仅要注意植物的果和根，也要注意植物的花、叶和其他器官的形态特征。1660年，雷伊运用自然分类法建立了一个植物的自然分类体系。此后，他逐渐转向动物学的研究，1693 年又建立起了一个动物的自然分类体系。
